1、血液学检查:包括血液常规、血糖、电解质、血钙等检查，有助于找到病因。
2、尿检:包括尿常规和遗传代谢病筛查，如怀疑苯丙酮尿症，应进行尿三氯化铁试验。
3、脑脊液检查:主要排除颅内感染等疾病。
4、遗传学检查:目前发现部分癫痫与遗传有关，特别是特殊癫痫类型，但目前医学发展阶段不能利用遗传学手段正常诊断癫痫。
5、其他检查:对于临床可疑病因，可根据临床需要或现实条件进行相应的其他特异性检查，例如，对于中毒引起癫痫的病例，可进行毒物筛查、代谢障碍的病例、相关检查等。
腰穿脑脊液检查和遗传学检查不是癫痫的常规检查。
血液学检查也用于药物不良反应的检查，常用的监视指标包括血常规和肝肾功能等。除了传统、生化、细菌培养涂层外，还应进行支原体、弓形体、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、囊虫病等病因检查，注意异常白细胞的细胞学检查。
通过遗传学检测预测癫痫的发生风险和遗传学发现指导治疗的研究也进一步探索。